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刘树深
发布时间 : 2016-06-08

职   务:教授

博士/硕士导师:博士、硕士生导师

办公室电话:021-65982767

电子邮箱:ssliuhl@263.net  、 ssliu@tongji.edu.cn

所在系所(部门):环境科学系

主要研究方向:化学混合物联合毒性与作用机制;有机物定量构效关系方法与应用;计算毒理学方法与软件设计

主讲课程:环境毒理学

校内外学术及行政兼职:


教育经历

1998-2001, 重庆大学生物工程学院生物医学工种博士生

1986-1988, 中国科学院盐湖研究研究所分析化学硕士生

1985-1986, 中国科学技术大学应用化学系硕士生

 

工作经历

2006-现在, 同济大学环境科学与工程学院, 教授, 博士生导师

2003-2006, 南京大学环境学院教授, 博士生导师

2001-2003, 南京大学环境科学与工程博士后流动站

1988-2001, 桂林理工大学(原桂林工学院), 讲师, 副教授, 教授, 硕士生导师

 

教育情况

主讲环境科学专业本科生《环境毒理学》课程; 指导环境科学专业本科生毕业实习与论文; 指导环境科学专业硕士生与博士生学位论文工作.

 

科研项目

1. 2015.01~2019.12, 土壤结合态农药的生物可利用性与潜在毒性(21437004),国家自然科学基金重点项目

2.2014.01~2017.12, 低剂量离子液体及相关混合物非单调剂量-效应曲线与分子机理研究(21377097), 国家自然科学基金项目

3.2012.01~2015.12, 非等效应非单调浓度-响应关系混合物通用浓度加和模型(21177097), 国家自然科学基金项目

4. 2010.01~2012.12, 基于效应分析的混合物整合加和预测模型研究(20977065), 国家自然科学基金项目

5. 2008.01~2010.12, 含J型剂量效应谱的低剂量混合污染物毒性相互作用研究(20777056),国家自然科学基金项目

6. 2007.12~2010.12,基于荧光素酶的混合污染物生物毒性测试技术(2007AA06Z417),国家高技术研究发展计划专题课题

 

代表学术论文
  1. Zhang, Yong-Hong*; Xia, Zhi-Ning; Li, Yan; Liu, Shu-Shen*. Prediction of Placental Barrier Permeability: A Model Based on Partial Least Squares Variable Selection Procedure. Molecules2015, 20(5), 8270-8286.

  2. Chen, Fu; Liu, Shu-Shen*; Yu, Mo; Qu, Rui; Wang, Meng-Chao. Blocking the entrance of AMP pocket results in hormetic stimulation of imidazolium-based ionic liquids to firefly luciferase. Chemosphere2015, 132: 108-113.

  3. Liu, Ling; Liu, Shu-Shen*; Yu, Mo; Chen, Fu. Application of the combination index integrated with confidence intervals to study the toxicological interactions of antibiotics and pesticides in Vibrio qinghaiensis sp.-Q67. Environ. Toxicol. Pharmacol. 2015, 39(1): 447-456.

  4. Zhang, Jing; Liu, Shu-Shen*. Time-dependent stimulations of 1-alkyl-3-methylimidazolium chloride on redox reactants and antioxidases in Vibrio qinghaiensis sp.-Q67. J. Hazard. Mater.2015, 283: 568-573.

  5. Chen, F.; Liu, S. S. *; Duan, X. T.; Xiao, Q. F. Predicting the mixture effects of three pesticides by integrating the molecular simulation with the concentration addition. RSC Adv. 2014, 4(61), 32256-32262.

  6. Zhang, Jin; Liu, S. S. *; Xiao, Q. F.; Huang, X. H; Chen, Q. Identifying the component responsible for antagonism within ionic liquid mixtures using the up-to-down procedure integrated with a uniform design ray method. Ecotoxicol. Environ. Safety2014, 107, 16-21.

  7. Zhang, Jing; Liu, S. S. *; Zhu, X. W. Benefits from hazards: Mixture hormesis induced by [emim]Cl despite its individual inhibitions. Chemosphere2014, 112, 420-426.

  8. Yu, M.; Liu, S. S. *; Wang, M. C.; Chen, F.; Tang, H. X. Mixture toxicities of three pesticides having different time-toxicity profiles. Chin. J. Chem. 2014, 32(6), 545-552.

  9. Ge, H. L.; Liu, S. S. *; Su, B. X.; Zhu, X. W. Two-Stage Prediction of the Effects of Imidazolium and Pyridinium Ionic Liquid Mixtures on Luciferase. Molecules2014, 19(5), 6877-6890.

  10. Ge, H. L.; Liu, S. S. *; Su, B. X.; Qin, L. T. Predicting synergistic toxicity of heavy metals and ionic liquids on photobacterium Q67. J. Hazard. Mater. 2014, 268, 77-83.

  11. 王猛超; 刘树深*; 陈浮. 拓展浓度加和模型预测三种三嗪类除草剂混合物的时间依赖毒性. 化学学报, 2014, 72(1), 56-60.

  12. Zhu, X. W.; Sedykh, A.(Alexander); Liu, S. S. *. Hybrid in silico models for drug-induced liver injury using chemical descriptors and in vitro cell-imaging information. J. Appl. Toxicol.2014, 34(3), 281-288.

  13. 刘树深*; 刘玲; 陈浮. 浓度加和模型在化学混合物毒性评估中的应用. 化学学报, 2013, 71(10), 1335-1340.

  14. Liu, S. S. *; Wang, C. L.; Zhang, J.; Zhu, X. W.; Li, W. Y. Combined toxicity of pesticide mixtures on green algae and photobacteria. Ecotoxicol. Environ. Safety2013, 95, 98-103

  15. 陈浮; 刘树深*; 段欣甜. 青海弧菌荧光素酶蛋白三维分子结构的分子模拟研究. 化学学报, 2013, 71(7), 1035-1040.

  16. Zhang, Jing.; Liu, S. S. *; Yu, Z. Y.; Liu, H. L.; Zhang, Jin. The time-dependent hormetic effects of 1-alkyl-3-methylimidazolium chloride and their mixtures on Vibrio qinghaiensis sp. -Q67. J. Hazard. Mater. 2013, 258-259, 70-76.

  17. Zhang, Jing.; Liu, S. S. *; Yu, Z. Y.; Zhang, Jin. Time-dependent hormetic effects of  1-alkyl-3- methylimidazolium bromide on Vibrio qinghaiensis sp.-Q67: luminescence, redox reactants and antioxidases. Chemosphere2013, 91(4), 462-467.

  18. Zhu, X. W.; Liu, S. S. *; Qin, L. T.; Chen, F.; Liu, H. L. Modeling Non-monotonic Dose-effect Relationships: Model Evaluation and Hormetic Quantities Exploration. Ecotoxicol. Environ. Safety2013, 89, 130-136.

  19. Zhu, X. W.; Sedykh, A.; Zhu, H.; Liu, S. S. *; Tropsha, A*. The Use of Pseudo-equilibrium Constant Affords Improved QSAR Models of Human Plasma Protein Binding. Pharm. Res. 2013, 30(7), 1790-1798.

  20. Qin, L. T.; Liu, S. S. *; Chen, F.; Wu, Q. S. Development of validated quantitative structure–retention relationship models for retention indices of plant essential oils. J. Sep. Sci.2013, 36(9-10),1553-1560.

  21. Qin, L. T.; Liu, S. S. *; Chen, F.; Xiao, X. F.; Wu, Q. S. Chemometric model for predicting retention indices of constituents of essential oil. Chemosphere2013, 90(2): 300-305.

  22. Zhang, Jin.; Liu, S. S. *; Zhang, J.; Qin, L. T.; Deng, H. P. Two novel indices for quantitatively characterizing the toxicity interaction between ionic liquid and carbamate pesticides. J. Hazard. Mater. 2012, 239-240, 102-109.

  23. 刘树深*; 张瑾; 张亚辉; 覃礼堂. APTox: 化学混合物毒性评估与预测.化学学报, 2012, 70(14), 1511-1517.

  24. Zhang, Jing.; Liu, S. S. *; Yu, Z. Y.; Liu, H. L. Significant contributions of ionic liquids containing tetrafluoroborate and trifluoromethanesulfonate to antagonisms and synergisms in multi-component mixtures. J. Hazard. Mater. 2012, 209-210, 158-163.

  25. Ge, H. L.; Liu, S. S.*; Zhu, X. W.; Liu, H. L.; Wang, L. J. Predicting Hormetic Effects of Ionic Liquid Mixtures on Luciferase Activity Using the Concentration Addition Model. Environ. Sci. Technol. 2011, 45(4), 1623-1629.

  26. Dou, R. N.; Liu, S. S.*; Mo, L. Y.; Liu, H. L.; Deng, F. C. A novel direct equipartition ray design (EquRay) procedure for toxicity interaction between ionic liquid and dichlorvos. Environ. Sci. Pollut. Res. 2011, 18(5), 734-742. Qin, L. T.; Liu, S. S.*; Liu, H. L.; Zhang, Y. H. Support vector regression and least squares support vector regression for hormetic dose-response curves fitting. Chemosphere 2010, 78(3), 327-334.

  27. Zhang, J.; Liu, S. S.*; Liu, H. L. Effect of ionic liquid on the toxicity of pesticide to Vibrio-qinghaiensis sp.-Q67. J. Hazard. Mater. 2009, 170(2-3), 920-927.

  28. Zhu, X. W.; Liu, S. S.*, Ge, H. L.; Liu, Yan. Comparison between the Short-Term and the Long-Term Toxicity of Six Triazine Herbicides on Photobacteria Q67. Water Res. 2009, 43(6), 1731-1739.

  29. Liu, S. S.*, Song, X. Q.; Liu, H. L.; Zhang, Y. H.; Zhang, J. Combined photobacterium toxicity of herbicide mixtures containing one insecticide. Chemosphere 2009, 75(3), 381-388.

  30. Zhang, Y. H.; Liu, S. S.*; Song, X. Q.; Ge, H. L. Prediction for the mixture toxicity of six organophosphorus pesticides to the luminescent bacterium Q67. Ecotoxicol. Environ. Safety 2008, 71(3), 880-888.

  31. Liu, S. S.; Liu, H. L.; Yin, C. S.; Wang, L. S. VSMP: A Novel Variable Selection and Modeling Method based on the Prediction. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2003, 43(3), 964-969.

  32. Liu, S. S.; Yin, C. S.; Wang, L. S. Combined MEDV-GA-MLR Method for QSAR of Three Panels of Steroids, Dipeptides, and COX-2 Inhibitors. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2002, 42(3), 749-756.

  33. Liu, S. S.; Yin, C. S.; Cai, S. X.; Li, Z. L. QSAR Study of Steroid Benchmark and Dipeptides Based on MEDV-13. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2001, 41(2), 321-329.

  34. Liu, S. S.; Cao, C. Z.; Li, Z. L. Approach to Estimation and Prediction for Normal Boiling Point (NBP) of Alkanes Based on a Novel Molecular Distance-Edge (MDE) Vector, l. J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1998, 38(3), 387-394.

 

获奖及专利

2012年度湖南省自然科学二等奖

2006年教育部自然科学奖二等奖

2004年重庆市自然科学奖二等奖

2003年度广西新世纪十百千人才工程第二层次人选

2003年全国优秀博士学位论文

  1. 发明人:窦容妮, 刘树深, 朱祥伟, 袁静. 一种检测二元混合物相互作用模式的多维等效应线图法. 申请号: 201010530079.0 (2010-11-03);公告号:102456096 (2012-05-16);专利权人: 同济大学. 发明专利证书号:第1440671,专利号:ZL 2010 1 0530079.0,授权公告日:2014年07月16号。

  2. 发明人:朱祥伟, 刘树深, 葛会林, 张丽芬. 基于青海弧菌Q67的环境污染物长期微板毒性分析法. 申请号: 201010230715.8 (2010-07-20);公告号:101915759 (2010-12-15);专利权人: 同济大学. 发明专利证书号:第1074425,专利号:ZL 2010 1 0230715.8,授权公告日:2012年11月7号。

 

软件与著作
  1. 刘树深. 化学混合物毒性评估与预测软件[简称:APTox]4.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第0660947号, 登记号: 2013SR155185,No. 00388104), 2013年12月24日。

  2. 刘树深. 化学混合物毒性评估与预测软件[简称:APTox], V3.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第0486106号, 登记号: 2012SR118070,No. 00201592), 2012年12月03日。

  3. 刘树深. 基于排序VIP的变量选择与模型化软件[简称:VIPLS], V1.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第0411872号, 登记号: 2012SR043836), 2012年05月26日。

  4. 覃礼堂, 刘树深. 整合加和模型评估混合物毒性软件[IMTox], V1.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第0276661号, 登记号: 2011SR012987), 2011年03月16日。

  5. 刘树深. 化学混合物毒性评估与预测软件[简称:APTox], V2.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第0228760号, 登记号: 2010SR040487), 2010年08月11日。

  6. 刘树深.混合污染物微板毒性检测实验设计软件[简称:EDMTM], V1.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第089594号, 登记号: 2008SR02366), 2008年01月31日。

  7. 刘树深. 化学混合物毒性评估与预测软件[简称:APTox], V1.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第062731号, 登记号: 2006SR15065), 2006年10月30日.

  8. 刘树深, 王晓栋, 尹大强, 张爱茜, 王连生. 基于预测的变量选择与模型化应用软件[简称:VSMP], V1.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第035973号, 登记号: 2005SR04472), 2005年05月09日.

  9. 刘树深, 尹大强, 王晓栋, 张爱茜, 王连生. 有机污染物活性估计与预测软件[简称:EPAOC], V1.0. 计算机软件著作权登记证书(证书号:软著登字第016560号, 登记号: 2003SR11469), 2003年11月06日.

  10. 尹大强, 林志芬, 刘树深等译. 生态风险评价(第二版), 北京: 高等教育出版社, 2011年6月

  11. 王连生主编. Advances in Chemistry of Organic Pollutants, 北京: 化学工业出版社, 2006年1月(刘树深为参编之一)

  12. 王连生主编. 有机污染化学进展, 北京: 化学工业出版社, 2006年1月(刘树深为参编之一)

  13. 刘树深著. 有机物分子电性距离矢量表征及其应用, 北京: 高等教育出版社, 2005年08月.

  14. 王连生主编. 有机污染物化学, 北京: 高等教育出版社, 2004年7月(刘树深编写第11和12章)

  15. 王连生等译. 环境有机化学, 北京: 化学工业出版社, 2004年1月(刘树深译第13,20和21章)

  16. 刘树深, 易忠胜编著. 基础化学计量学, 北京: 科学出版社, 1999年8月.

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